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調節微生態

在酸性條件下，殼寡糖分子中的游離氨基質子化，質子化按能與細菌帶正電的細胞膜作用，干擾細菌細胞膜功能，造成細菌體內細胞質流失，對真菌和微生物的生長有。 其活性與菌種和濃度有關，且隨濃度加大其活性增強，高濃度時有殺菌作用。

甲殼低聚糖是BF的一種重要種類，它能調節動物內微生物的代謝活動，改善微生物區系分布，促進雙歧桿菌生長繁殖，從而，使內pH下降，抑制有害菌生長，產生B族維生素，分解，，增進蛋白質吸收。

改善組織形態

提高動物的生產性能殼寡糖使回腸微絨毛密度增加，同時也有變細、變高的傾向。 微絨毛高度增加，密度加大，利于增大小腸的吸收面積，促進營養物質的吸收，提高飼料的利用率。