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在中樞，尤其是在脊椎里，甘氨酸是一個抑制性神經遞質。假如甘氨酸接受器被激活，氯離子通過離子接受器進入導致抑制性突觸后電位。是這些離子接受器的拮抗物。在鼠體內其LD50指標為0.96毫克/千克體重，死因是超興奮性。在中樞中甘氨酸與谷氨酸同是激動劑。甘氨酸以往一直被認為是除了GABA以外最重要的抑制性神經遞質。甘氨酸在CNS中有廣泛的分布,在神經信號的傳遞以及參與各種生理和病理反應中起著的重要基礎作用。

研究表明，甘氨酸提高了新生仔豬小腸上皮細胞的生長與增殖以及抗氧化應激的能力，促進了新生仔豬小腸黏膜發育；同時，日糧中添加甘氨酸提高了新生和斷奶仔豬的生長性能，促進了發育與健康。

人體若攝入甘氨酸的量過多，不僅不能被人體吸收利用，而且會打破人體對氨基酸的吸收平衡而影響其它氨基酸的吸收，導致營養失衡而影響健康。以甘氨酸為主要原料生產的含乳飲料，對青少年及兒童的正常很容易帶來不利影響。 

作為氨基酸源，占食品中總蛋白質量的3.5%（FDA，§172．320，2000）。